Die Transmembrandomäne (TMD) des C99 Fragments, das Teil des Alzheimerschen Amyloid Vorläuferproteins ist, wird durch die γ-Sekretase sequentiell prozessiert. Die Abundanz an β-verzweigten Residuen in der Spaltregion gab Anlass zur These, dass lokales, transientes Auffalten der TMD-Helix Einfluss auf die Proteolyse hat. In dieser Arbeit wurde ihre Peptidrückgratdynamik mittels Deuterium-Wasserstoff-Austausch-Experimenten gekoppelt an die Elektrospray-Ionisation-Massen-spektrometrie von Modellpeptiden charakterisiert. Die N-terminale Glyzin-reiche Dimerregion ist sehr dynamisch. Die C-terminale Spaltregion ist moderat dynamisch und ist im Vergleich zu Nichtsubstrat-TMDs mit durchschnittlicher Residuenzusammensetzung nicht dynamischer, da ihre Threonine die Helix durch zusätzliche H-Brücken zum Rückgrat stabilisieren. Die Helixdynamik der freien C-Termini der Spaltfragmente erhöhte sich mit jeder weiteren Spaltstelle zum N-Terminus.     «

Die Transmembrandomäne (TMD) des C99 Fragments, das Teil des Alzheimerschen Amyloid Vorläuferproteins ist, wird durch die γ-Sekretase sequentiell prozessiert. Die Abundanz an β-verzweigten Residuen in der Spaltregion gab Anlass zur These, dass lokales, transientes Auffalten der TMD-Helix Einfluss auf die Proteolyse hat. In dieser Arbeit wurde ihre Peptidrückgratdynamik mittels Deuterium-Wasserstoff-Austausch-Experimenten gekoppelt an die Elektrospray-Ionisation-Massen-spektrometrie von Modellpep...     »

The transmembrane domain (TMD) of the C99 fragment which is part of the Alzheimer’s Amyloid Precursor Protein is sequentially processed by the γ-secretase. The abundance of β-branched residues in the cleavage region gives the rationale that local, transient unfolding of the TMD helix might be important to proteolysis. In the present work, its backbone dynamics was characterized on model peptides with deuterium/hydrogen exchange experiments coupled to electrospray ionization mass spectrometry. The N-terminal glycine-rich dimerization domain is highly dynamic. The C-terminal cleavage region is moderately dynamic and is not more dynamic than a non-substrate TMD with average residue composition because its threonine residues stabilize the helix with additional H-bonds to the backbone. The helix dynamics of the free C-termini of the fragments was increased with each further cleavage site towards the N-terminus.     «

The transmembrane domain (TMD) of the C99 fragment which is part of the Alzheimer’s Amyloid Precursor Protein is sequentially processed by the γ-secretase. The abundance of β-branched residues in the cleavage region gives the rationale that local, transient unfolding of the TMD helix might be important to proteolysis. In the present work, its backbone dynamics was characterized on model peptides with deuterium/hydrogen exchange experiments coupled to electrospray ionization mass spectrometry. Th...     »